Os comitês, comissões e outros grupos colegiados, destacados nesta página, constituem instâncias internas de Governança, que exercem importante papel na estrutura da Justiça Federal da 3.ª Região, apresentando estudos, propostas, subsidiando e dando apoio técnico às decisões da Alta Administração. 

Algumas comissões e comitês têm caráter permanente, instituídas em razão de normativos do Conselho Nacional de Justiça e do Conselho da Justiça Federal, outros colegiados são estabelecidos em razão do Regimento Interno do Tribunal ou, ainda, em razão de outros normativos ou políticas estabelecidas pela Alta Administração. 

Além disso, há magistradas, magistrados, servidoras e servidores que participam de comissões, conselhos e assemelhados, estabelecidos por outros órgãos, caracterizando atuação externa à instituição.